Die Kirchengemeinde entstand 1962 in dem Cuxhavener Stadtteil Süderwisch, der insbesondere für die vielen Heimatvertriebenen errichtet wurde.
Im Jahr 1972 wurde neben der Kirche eine Kindertagesstätte gebaut, die in modernen Räumen heute circa 120 Kindern einen Platz bietet.
Im Jahr 2008 erhielt die Kirche einen An- und Umbau, so dass der Kirchraum multifunktional auch für andere Gemeindeveranstaltungen genutzt werden kann. Mehrmals in einem Jahr werden hier sogenannte Filmgottesdienste angeboten.
Seit 2013 arbeiten fünf Innenstadtgemeinden von Cuxhaven - die Kirchengemeinden St. Gertrud, St. Petri, Emmaus, Martin und Gnaden - in einem pfarramtlichen Verbund zusammen. Sie geben einen zentralen Gemeindebrief heraus und betreiben ein zentrales Kirchenbüro.
Hans-Christian Engler, Pastor
